有媒體報導，台鐵委外進行的「票價差別費率研究報告」出爐，建議普悠瑪、太魯閣等自強號票價漲百分之五以上，柴聯自強號則建議降一成，如果以台北到花蓮為例，普悠瑪等新車將貴二十二元、柴聯自強號可降四十四元。不過，台鐵發布新聞稿表示，暫時沒有調漲票價的規劃。

由於新型普悠瑪和太魯閣列車，比一般自強號速度快四十分鐘以上，研究報告才會建議百分之五漲幅。但台鐵表示，如果真的漲價，營收將短收五千萬，暫時沒有調整規畫。（圖：台鐵普悠瑪列車 取自維基百科）